心脏灌流心肌细胞蛋白组学检测

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所在栏目:其他检测
发布时间:2025-07-26
信息来源:北检院
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检测项目

全蛋白组定性分析:

  • 蛋白鉴定数量:≥1000种(基于LC-MS/MS分析)
  • 肽段匹配率:≥95%(参照ISO23036-1)
  • 序列覆盖率:≥30%(单蛋白平均覆盖度)
差异蛋白定量分析:
  • 差异表达倍数:≥1.5倍(上调)、≤0.67倍(下调)
  • 统计显著性:P值≤0.05(t检验)、假阳性率(FDR)≤0.01(Benjamini-Hochberg校正)
  • 动态范围:≥10^4(低丰度至高丰度蛋白覆盖)
翻译后修饰分析:
  • 磷酸化修饰:丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、酪氨酸(Tyr)位点鉴定(≥500个位点)
  • 乙酰化修饰:赖氨酸(Lys)位点占有率≥5%(基于iTRAQ标记)
  • 泛素化修饰:ubiquitin链类型(K48、K63连接)分析
蛋白相互作用分析:
  • 相互作用对数量:≥500对(基于Co-IP-MS)
  • 核心调控蛋白网络:度中心性≥10(Cytoscape分析)
  • 共表达相关性:Pearson系数≥0.8(蛋白表达量关联)
亚细胞定位分析:
  • 细胞质蛋白比例:±5%(通过差速离心分离)
  • 线粒体蛋白富集度:≥2倍(相对于总蛋白)
  • 细胞核蛋白纯度:≥90%(Westernblot验证)
代谢通路富集分析:
  • 通路富集分数:NES≥1.5(GSEA分析)
  • 差异蛋白涉及通路数量:≥10条(如PI3K-Akt、MAPK通路)
  • 关键节点蛋白:折叠变化(FC)≥2倍(通路核心分子)
低丰度蛋白检测:
  • 低丰度蛋白鉴定数量:≥200种(如细胞因子、信号分子)
  • 检测下限:≤10fmol(质谱信噪比≥10:1)
  • 回收率:≥85%(spiked-in标准蛋白)
蛋白降解途径分析:
  • 蛋白酶体降解靶点:≥50种(基于MG132抑制实验)
  • 自噬相关蛋白表达:LC3-II/LC3-I比值≥2(Westernblot)
  • 泛素化蛋白半衰期:≤24h(cycloheximidechase实验)
心肌特异性蛋白验证:
  • 肌钙蛋白I(cTnI):表达量≥1000ng/mg蛋白(ELISA定量)
  • 肌球蛋白重链(MYH7):异构体比例±3%(qPCR验证)
  • 结蛋白(Desmin):纤维完整性≥90%(共聚焦显微镜观察)
药物干预后蛋白响应分析:
  • 药物靶点结合率:≥80%(基于Pull-down实验)
  • 下游效应蛋白变化:≥1.8倍(如AKT磷酸化水平)
  • 脱靶效应蛋白数量:≤10种(差异蛋白筛选)

检测范围

1.正常对照心肌细胞:来自健康成年动物或供体的离体灌流心脏,重点检测基础蛋白表达谱及翻译后修饰(如磷酸化、乙酰化)基线水平

2.缺血再灌注损伤心肌细胞:模拟心梗后再灌注模型(缺血30min+再灌注2h),侧重氧化应激相关蛋白(如SOD、GPx)及凋亡蛋白(如Bax/Bcl-2比值)变化

3.心力衰竭模型心肌细胞:压力超负荷诱导的心室重构模型(主动脉缩窄术),重点分析肌小节蛋白(如cTnT、MYH6)及细胞外基质蛋白(如collagenI/III比值)表达

4.药物处理心肌细胞:β受体阻滞剂(如美托洛尔)、ACEI类药物(如依那普利)干预后,检测靶点蛋白(如β1-AR、ACE)及下游信号通路(如cAMP-PKA)蛋白变化

5.基因编辑心肌细胞:CRISPR/Cas9修饰的突变体(如MYH7R403Q突变),重点验证突变蛋白的表达量、折叠状态及与伴侣蛋白(如HSP70)的相互作用

6.糖尿病心肌病心肌细胞:高糖(30mMglucose)诱导的代谢紊乱模型,侧重糖代谢相关蛋白(如GLUT4)及脂毒性蛋白(如FFA合成酶)分析

7.病毒性心肌炎心肌细胞:柯萨奇病毒B3(CVB3)感染模型,重点检测病毒受体蛋白(如CAR)及免疫炎症相关蛋白(如IL-6、TNF-α)表达

8.老龄化心肌细胞:老年动物(18-24个月龄)离体心脏,侧重衰老相关蛋白(如p53、SIRT1)及端粒酶活性相关蛋白(如TERT)的表达变化

9.心肌梗死边缘区细胞:心梗后存活心肌组织(梗死周边1cm区域),重点分析修复相关蛋白(如VEGF、TGF-β)及血管生成因子(如ANGPT1)的表达

10.干细胞来源心肌细胞:iPSC诱导分化的心肌细胞(成熟度≥80%),侧重心肌特异性蛋白(如cTnT、α-MHC)的鉴定及电生理相关蛋白(如Nav1.5)的表达

检测方法

国际标准:

  • ISO23036-1:2021蛋白质组学-液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)分析总则
  • ASTME3294-21差异蛋白质组学定量分析指南(同位素标记法)
  • ICHQ6B生物制品中蛋白质鉴定与纯度分析
国家标准:
  • GB/T37840-2019蛋白质组学研究质谱分析数据处理规范
  • GB/T38485-2020差异蛋白质组学定量方法同位素标记法
  • YY/T1858-2022生物样本中蛋白质表达谱分析液相色谱-串联质谱法
方法差异说明:ISO23036-1侧重质谱数据的重复性(RSD≤10%)与准确性要求,而GB/T37840更强调数据处理的标准化流程(如肽段匹配算法、FDR校正);ASTME3294推荐的TMT标记法定量精度(±5%)高于GB/T38485中的标记-free法(±10%);ICHQ6B针对生物制品的蛋白鉴定要求肽段覆盖率≥40%,高于普通样本的30%要求(ISO23036-1)。

检测设备

1.液相色谱-质谱联用仪:ThermoScientificOrbitrapFusionLumos(分辨率≥500,000FWHM,扫描速度≥20Hz,质量精度≤1ppm)

2.高分辨质谱仪:BrukertimsTOFPro(离子迁移率分辨率≥100,动态范围≥10^5,检测限≤5fmol)

3.纳升液相色谱系统:EksigentekspertnanoLC425(流速范围50-1000nL/min,柱温稳定性±0.1℃,分离度≥1.8)

4.蛋白质分离系统:Agilent1290InfinityII(压力≥1200bar,峰宽≤10sec,流速精度±0.1%)

5.同位素标记定量系统:ABSciexTripleTOF6600(标记效率≥98%,扫描速度≥100spectra/sec,线性范围≥10^4)

6.蛋白免疫印迹系统:Bio-RadChemiDocMP(检测限≤1pg,线性范围≥5个数量级,曝光时间精度±0.1sec)

7.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(荧光通道≥18,分选速度≥10,000cells/sec,分选纯度≥99%)

8.共聚焦显微镜:LeicaTCSSP8(分辨率≤150nm,扫描速度≥8fps,荧光灵敏度≥1photon/sec)

9.生物分子相互作用仪:GEBiacoreT200(亲和力检测范围10^-6-10^-12M,流速范围1-100μL/min,响应时间≤1sec)

10.低温超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXE-90(转速≥90,000rpm,离心力≥500,000xg,温度稳定性±0.5℃)

11.超高压液相色谱仪:WatersACQUITYUPLCH-Class(压力≥15,000psi,分离度≥1.5,柱温范围4-80℃)

12.基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪:BrukerautoflexmaX(质量范围500-1,000,000Da,分辨率≥20,000,检测限≤1pmol)

13.蛋白质定量分析仪:ThermoScientificQubit4(检测范围1-500μg/mL,精度±5%,检测时间≤5min)

14.生物样本均质器:BulletBlenderStorm(均质效率≥95%,样本温度≤4℃,处理量≥24个样本/批)

15.蛋白结晶仪:RigakuCrystalMation(滴液体积精度±0.1nL,温度范围4-40℃,湿度控制≥95%)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是关于心脏灌流心肌细胞蛋白组学检测相关介绍,如果您还有其他疑问,可以咨询在线工程师提交您的需求,为您提供一对一解答。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

服务优势

1、拥有完善的检测服务体系,科学、严谨、认证。

2、我院对已出过的报告负责。

3、提供编写MSDS报告、TDS报告服务。

4、检测服务领域广,可参考标准多(国标、企标、通标、工标、国际标准等)。

5、周期短,费用低,方案全。

6、支持定制化试验方案,数据更加科学准确。

7、全国上门取样/现场见证试验。

8、资质全,团队强,后期服务体系完善

报告作用

1、工业问题诊断:包括失效分析、科学诊断、数据验证等,可以快速检测出产品问题,尽快止损;

2、其他鉴定服务:协助相关部门证据链补充、证物材料补充、质量检测、样品分析;

4、研发使用:试验经验丰富,试验设备多,为科研工作提供数据支持;

3、高校论文:提供研究性实验数据、分析服务,给论文提供科学依据;

5、投标:检测周期短,准确性高,出具的第三方检测报告合法合规;

7、控制材料质量,进行产品内控,降低成本、风险。

试验流程

1、与工程师沟通,确定具体的试验方案,我方报价;

2、双方签订委托书,我方接收样品;

3、进行细节沟通,我方进行试验测试;

4、试验测试完成,出具检测测试报告;

5、委托完成,我方提供售后服务。

检测流程

检测仪器(部分)

实验仪器

实验仪器-手机

合作客户(部分)

合作客户

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