肿瘤基因突变测试灵敏度测试

检测项目

DNA样本质量控制：

• DNA浓度：≥10ng/μl(Qubit荧光法)
• DNA完整性指数：≥7.0(生物分析仪测量)
• 纯度检测：A260/A280比值1.8-2.0(分光光度计法)

PCR扩增优化：

• 扩增效率：90%-110%(qPCR标准曲线)
• 特异性偏差：≤5%非目标扩增(熔解曲线分析)
• 引物二聚体抑制：Ct值延迟≤1循环(参照CLSIMM19)

NGS文库构建：

• 接头连接效率：≥95%(凝胶电泳验证)
• 文库浓度：≥2nM(荧光定量法)
• 片段大小分布：150-300bp(峰值分析)

测序性能评估：

• 最低检测限：≤0.1%VAF(突变模拟样本验证)
• 测序覆盖均匀性：CV≤20%(深度分布计算)
• 错误率控制：≤0.1%碱基错误(阳性对照基准)

变异检测算法：

• 灵敏度指标：≥99%召回率(标准参考数据集)
• 特异性指标：≥98%精确度(假阳性控制)
• 变异调用阈值：VAF≥0.5%置信区间(统计模型优化)

质量控制样本测试：

• 阳性对照突变率：98%-102%预期值(掺入突变样本)
• 阴性对照假阳性：≤0.01%突变检出(野生型样本验证)
• 内参基因稳定性：Ct值SD≤0.5(管家基因监测)

重现性评估：

• 批次间变异系数：CV≤15%(多批次重复测试)
• 操作员间一致性：Kappa值≥0.9(盲样交叉验证)
• 设备重现性：RSD≤10%(同型号设备比对)

特异性测试：

• 交叉反应抑制：≤5%非目标信号(多基因面板干扰试验)
• 背景噪声控制：信噪比≥20:1(测序数据过滤)
• 同源序列区分：100%正确识别率(SNP干扰模拟)

线性范围验证：

• 突变频率响应：R²≥0.98(0.1%-50%VAF梯度)
• 定量准确性：偏差≤±10%(标准曲线拟合)
• 动态范围下限：≥5拷贝(低丰度样本测试)

样本处理效率：

• 提取回收率：≥90%(spike-in回收实验)
• 处理时间偏差：≤10%标准时长(自动化流程监控)
• 样本稳定性：降解率≤5%/月(存储条件测试)

检测范围

1.新鲜冷冻组织样本：重点评估高突变负荷下的灵敏度，确保DNA完整性维持检测精度

2.FFPE组织样本：关注DNA交联和降解影响，优化低频突变检出率和错误校正

3.血浆游离DNA样本：侧重低频突变(0.1%VAF)检测，控制背景噪声和取样偏差

4.全血样本：应对白细胞污染挑战，强化特异性和突变分离效率

5.尿液样本：非侵入性检测优化，聚焦DNA浓度不足时的灵敏度提升

6.脑脊液样本：针对低细胞量样本，确保微量突变可靠检出和重复性

7.唾液样本：口腔癌相关突变检测，处理微生物干扰和样本异质性

8.活检穿刺样本：小样本量适应性测试，强调提取效率和覆盖深度均匀性

9.细胞学样本：体液细胞检测，验证变异调用算法在低质量DNA中的稳定性

10.石蜡包埋组织：归档样本重现性评估，侧重DNA修复方法和突变恢复率

检测方法

国际标准：

• CLSIMM19分子诊断测试性能评估
• ISO15189:2022医学实验室质量和能力要求
• ISO20395:2018生物技术核酸测序灵敏度测试指南
• FDA-NGS指南肿瘤突变检测验证框架

国家标准：

• GB/T37864-2019生物样本库质量和能力通用要求
• YY/T1596-2017高通量基因测序仪通用技术要求
• GB/T30988-2014分子生物学检测方法验证通则
• WS/T420-2013临床基因检测实验室指南

(差异说明：ISO标准强调VAF≥1%检测限验证，而GB标准侧重≥0.5%阈值设定；CLSI要求多中心重现性测试，YY/T规范设备参数校准；FDA指南包含临床样本验证层级，WS/T则聚焦实验室操作流程一致性)

检测设备

1.NGS测序仪：IlluminaNovaSeq6000(通量：最高6Tb/run，读长2x150bp)

2.qPCR仪：ABIQuantStudio7(动态范围：10^7，温控精度±0.1°C)

3.微阵列扫描仪：AffymetrixGeneChipScanner3000(分辨率：2.5μm，波长范围：488-690nm)

4.毛细管电泳仪：ABI3500xL(片段分析范围：35-600bp，精度：±1bp)

5.分光光度计：ThermoScientificNanoDropOne(波长：190-840nm，检测限：2ng/μl)

6.荧光定量仪：LifeTechnologiesQubit4.0(检测限：0.2ng/μl，染料：dsDNAHS)

7.自动化核酸提取仪：RocheMagNAPure96(通量：96样本/run，回收率≥95%)

8.生物分析仪：Agilent2100Bioanalyzer(DNA完整性检测范围：50-7000bp，分辨率：1bp)

9.高速离心机：Eppendorf5430R(转速：15000rpm，容量：24x1.5ml)

10.热循环仪：Bio-RadT100(温控范围：4-99°C，升降温速率：4°C/s)

11.荧光显微镜：OlympusBX53(放大倍数：40-1000x，光源：LED)

12.细胞计数器：ThermoFisherCountessIIFL(检测通道：双荧光，计数范围：10^4-10^7/ml)

13.冷冻切片机：LeicaCM1950(切片厚度：1-50μm，温度范围：-50°C至0°C)

14.恒温水浴锅：MemmertWNB14(温度范围：室温至100°C，稳定性±0.1°C)

15.pH计：MettlerToledoSevenExcellence(测量范围：0-14pH，精度：±0.01pH)

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是关于肿瘤基因突变测试灵敏度测试相关介绍，如果您还有其他疑问，可以咨询在线工程师提交您的需求，为您提供一对一解答。

注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试，望谅解（高校、研究所等性质的个人除外）。

服务优势

1、拥有完善的检测服务体系，科学、严谨、认证。

2、我院对已出过的报告负责。

3、提供编写MSDS报告、TDS报告服务。

4、检测服务领域广，可参考标准多（国标、企标、通标、工标、国际标准等）。

5、周期短，费用低，方案全。

6、支持定制化试验方案，数据更加科学准确。

7、全国上门取样/现场见证试验。

8、资质全，团队强，后期服务体系完善

报告作用

1、工业问题诊断：包括失效分析、科学诊断、数据验证等，可以快速检测出产品问题，尽快止损；

2、其他鉴定服务：协助相关部门证据链补充、证物材料补充、质量检测、样品分析；

4、研发使用：试验经验丰富，试验设备多，为科研工作提供数据支持；

3、高校论文：提供研究性实验数据、分析服务，给论文提供科学依据；

5、投标：检测周期短，准确性高，出具的第三方检测报告合法合规；

7、控制材料质量，进行产品内控，降低成本、风险。

试验流程

1、与工程师沟通，确定具体的试验方案，我方报价；

2、双方签订委托书，我方接收样品；

3、进行细节沟通，我方进行试验测试；

4、试验测试完成，出具检测测试报告；

5、委托完成，我方提供售后服务。

检测仪器(部分)

合作客户(部分)

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