RNA-protein结合试验

关键字:RNA-protein结合试验,北检(北京)检测技术研究院,第三方测试机构
所在栏目:其他检测
发布时间:2025-09-03
信息来源:北检院
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检测项目

结合亲和力检测:

  • 解离常数测定:Kd值(范围0.1nM-100μM,参照ISO15197:2013)
  • 结合常数计算:Ka值(≥1×10^6M⁻¹)
  • 饱和结合分析:Bmax值(单位fmol/mg)
动力学参数分析:
  • 结合速率测量:kon值(单位M⁻¹s⁻¹)
  • 解离速率评估:koff值(单位s⁻¹)
  • 平衡时间确定:t1/2(≥0.5s)
特异性验证:
  • 交叉反应性测试:非靶蛋白抑制率(≤5%)
  • 序列特异性分析:错配碱基容忍度(≤2nt)
  • 同源物干扰评估:同源性≤80%时的结合干扰
热力学研究:
  • 焓变测定:ΔH值(单位kJ/mol)
  • 熵变计算:ΔS值(单位J/mol·K)
  • 自由能变化:ΔG值(≤-30kJ/mol)
结构表征:
  • 结合位点映射:分辨率≤2Å
  • 构象变化监测:RMSD值(≤0.5nm)
  • 二级结构分析:α-螺旋含量变化(±10%)
功能活性assay:
  • 酶活性抑制:IC50值(单位nM)
  • 转录调控效率:荧光素酶报告基因活性(foldchange≥2)
  • 细胞定位验证:核质比例(≥1.5)
高通量筛选:
  • 芯片-based结合:点阵密度≥1000spots/cm²
  • 荧光偏振检测:Z'因子(≥0.5)
  • 自动化吞吐量:≥1000samples/day
体内结合试验:
  • 细胞结合效率:摄取率(≥70%)
  • 动物模型验证:肿瘤抑制率(≥50%)
  • 生物分布分析:组织浓度(单位ng/g)
质量控制参数:
  • RNA纯度检测:A260/A280比值(1.8-2.0)
  • 蛋白稳定性:降解率(≤5%/24h)
  • 结合重现性:CV值(≤15%)
生物信息学预测:
  • 序列比对一致性:E-value(≤1e-5)
  • 结构模拟精度:TM-score(≥0.5)
  • 结合能计算:dG值(单位kcal/mol)

检测范围

1.mRNA与核糖体蛋白结合:重点检测翻译起始复合物形成效率、Kozak序列依赖性结合强度

2.siRNA与Argonaute蛋白结合:侧重RISC负载效率、guidestrand选择特异性、off-target效应评估

3.lncRNA与染色质修饰蛋白:检测组蛋白甲基化调控、nuclearspeckle定位、基因沉默效率

4.病毒RNA与宿主蛋白结合:关注复制复合体组装、immuneevasion机制、聚合酶相互作用

5.适配体与靶蛋白结合:重点验证高亲和力(Kd≤nM)、构象切换、诊断应用可行性

6.核糖核酸酶与底物RNA:检测酶切速率、特异性位点识别、抑制剂筛选

7.转录因子与DNA结合域:侧重顺式元件亲和力、二聚化影响、磷酸化调控

8.剪接因子与pre-mRNA结合:关注分支点识别、exonskipping效率、突变体功能丧失

9.端粒酶RNA与蛋白组分:检测端粒延长活性、processivity、癌症相关突变影响

10.微小RNA与RISC复合物:重点评估靶mRNA抑制、种子序列匹配、组织特异性表达

检测方法

国际标准:

  • ISO15197:2013体外诊断系统-核酸蛋白结合试验要求
  • ISO10993-5:2009生物相容性测试-分子相互作用评估
  • IEEE1278:2015生物分子相互作用测量标准(动力学参数)
国家标准:
  • GB/T37872-2019RNA蛋白结合试验通用要求
  • GB/T34796-2017核酸结合蛋白活性测定方法
  • GB/T34224-2017生物芯片技术规范(高通量筛选)
方法差异说明:国际标准ISO15197强调临床验证和精度控制,而国家标准GB/T37872更注重科研应用和参数范围;ISO10993-5包含生物安全性评估,GB/T34796聚焦体外活性测定;IEEE标准适用于高端仪器参数,而GB/T34224针对芯片技术有详细操作流程。

检测设备

1.表面等离子共振仪:BiacoreT200型(检测限0.1RU,流速范围1-100μL/min)

2.等温滴定calorimeter:MicroCalPEAQ-ITC型(温度范围2-80°C,灵敏度0.1μcal/s)

3.荧光偏振仪:SpectraMaxiD5型(波长范围250-850nm,精度±2mP)

4.凝胶电泳系统:Bio-RadChemiDocMP型(分辨率3MP,曝光时间0.1-60s)

5.实时PCR仪:AppliedBiosystems7500Fast型(升温速率5°C/s,通道数5)

6.质谱仪:ThermoFisherOrbitrapFusion型(分辨率240000,质量精度<1ppm)

7.核磁共振仪:BrukerAvanceNEO600MHz型(场强14.1T,探头类型cryoPROBE)

8.X射线晶体学设备:RigakuSynergy-S型(波长1.5418Å,探测器面积300mm²)

9.原子力显微镜:BrukerDimensionIcon型(分辨率原子级,扫描范围90μm)

10.流式细胞仪:BDFACSymphonyA5型(参数数50,速度100000events/s)

11.微阵列扫描仪:AgilentSureScanDx型(分辨率2μm,扫描速度slides/hour)

12.超速离心机:BeckmanCoulterOptimaXPN-100型(最大转速100000rpm,温度控制±0.1°C)

13.圆二色谱仪:JascoJ-1500型(波长范围160-250nm,数据采集速率10Hz)

14.生物传感器平台:SartoriusOctetRED96e型(检测时间实时,通量96samples/run)

15.高通量筛选系统:PerkinElmerEnVision型(读板速度1s/well,兼容platetypes)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是关于RNA-protein结合试验相关介绍,如果您还有其他疑问,可以咨询在线工程师提交您的需求,为您提供一对一解答。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

服务优势

1、拥有完善的检测服务体系,科学、严谨、认证。

2、我院对已出过的报告负责。

3、提供编写MSDS报告、TDS报告服务。

4、检测服务领域广,可参考标准多(国标、企标、JianCe、工标、国际标准等)。

5、周期短,费用低,方案全。

6、支持定制化试验方案,数据更加科学准确。

7、全国上门取样/现场见证试验。

8、资质全,团队强,后期服务体系完善

报告作用

1、工业问题诊断:包括失效分析、科学诊断、数据验证等,可以快速检测出产品问题,尽快止损;

2、其他鉴定服务:协助相关部门证据链补充、证物材料补充、质量检测、样品分析;

4、研发使用:试验经验丰富,试验设备多,为科研工作提供数据支持;

3、高校论文:提供研究性实验数据、分析服务,给论文提供科学依据;

5、投标:检测周期短,准确性高,出具的第三方检测报告合法合规;

7、控制材料质量,进行产品内控,降低成本、风险。

试验流程

1、与工程师沟通,确定具体的试验方案,我方报价;

2、双方签订委托书,我方接收样品;

3、进行细节沟通,我方进行试验测试;

4、试验测试完成,出具检测测试报告;

5、委托完成,我方提供售后服务。

检测流程

检测仪器(部分)

实验仪器

实验仪器-手机

合作客户(部分)

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