表观基因表达功效评价

检测项目

DNA甲基化分析：

• 全基因组甲基化谱：CpG位点覆盖率≥98%，甲基化率(%)
• 启动子区域甲基化水平：差异甲基化区域DMR检出限(0.1%频率)
• 羟甲基化定量：5-hmC占比(ppm级精度)

组蛋白修饰检测：

• 组蛋白甲基化修饰：H3K4me3/H3K27me3富集倍数(ChIP-qPCR≥5X)
• 组蛋白乙酰化水平：H3K9ac修饰丰度(质谱精度±0.01Da)
• 修饰位点定位：ChIP-seq峰值信噪比(≥10:1)

非编码RNA调控：

• lncRNA结合效率：RNApulldown回收率(≥80%)
• miRNA靶向验证：双荧光素酶抑制率(≥70%)

染色质可及性：

• ATAC-seq开放区域：Tn5转座酶切割效率(≥90%)
• 核小体定位：MNase消化片段大小(146±5bp)

三维基因组构象：

• 染色质互作频率：Hi-C交互矩阵分辨率(≤5kb)
• 拓扑关联域：TAD边界强度(绝缘评分≥0.5)

表观遗传编辑验证：

• CRISPR-dCas9靶向效率：脱靶率(≤0.1%)
• 甲基转移酶编辑：甲基化新增广度(≥200bp范围)

单细胞表观分析：

• scATAC-seq细胞捕获：细胞通量(10,000细胞/run)
• 单细胞甲基化异质性：UMI错误率(≤0.01%)

表观标记传递性：

• 有丝分裂继承率：甲基化维持精度(≥95%)
• 跨代遗传稳定性：F3代修饰保留度(≥80%)

表观药物响应：

• 去甲基化剂IC50：剂量响应曲线R²(≥0.99)
• 组蛋白脱乙酰酶抑制：EC50重复性(CV≤5%)

多组学整合分析：

• 表观-转录组关联：甲基化-mRNA负相关(r≤-0.7)
• 修饰动态追踪：时间分辨率(≤15min间隔)

检测范围

1.肿瘤组织样本：聚焦癌基因超甲基化与抑癌基因低甲基化区域定量

2.外周血游离DNA：液态活检中cfDNA片段化模式与甲基化标志物检测

3.干细胞分化模型：多能性基因座甲基化重编程动态监测

4.转基因动物模型：跨代表观遗传修饰的组织特异性分布

5.植物胁迫响应组织：环境诱导的转座子甲基化沉默效率

6.微生物表观变异体：限制修饰系统甲基转移酶活性验证

7.体外细胞系模型：组蛋白修饰抑制剂处理后的核小体重构

8.古DNA样本：降解样本中胞嘧啶脱氨基率校正

9.胚胎发育组织：印记控制区甲基化等位基因偏好性分析

10.类器官培养物：三维结构中染色质空间构象保真度

检测方法

国际标准：

• ENCODEChIP-seq指南v2.0(输入DNA≥10ng，抗体验证要求)
• RRBS甲基化分析标准(MspI酶切效率≥95%，覆盖>1MCpG)
• Hi-C3.0协议(交联时间优化15min，有效接触对占比≥80%)

国家标准：

• GB/T37872-2019高通量甲基化检测方法(亚硫酸盐转化率≥99.5%)
• GB/T34797-2017组蛋白修饰质谱检测(修饰肽段检出限0.1fmol)
• YY/T1742-2021医学高通量测序仪性能(Q30≥85%)

方法差异说明：国际标准要求BS-seq双链一致性>90%，国标要求>85%；国际ATAC-seq建议500-50,000细胞输入量，国标规定≥1000细胞

检测设备

1.高通量甲基化测序仪：IlluminaNovaSeq6000(通量20Breads/run，Q30≥90%)

2.质谱检测系统：ThermoOrbitrapFusionLumos(质量精度<1ppm，分辨率480k)

3.单细胞分离平台：10xGenomicsChromiumController(捕获效率≥65%)

4.染色质构象捕获系统：DovetailGenomicsChicago(文库复杂度>0.8)

5.超声破碎仪：CovarisM220(聚焦超声碎片大小100-500bp)

6.组蛋白修饰分析仪：PerkinElmerLabChipGXII(修饰定量CV<5%)

7.全自动液体处理站：BeckmanBiomeki7(移液精度±0.5%)

8.焦磷酸测序仪：QiagenPyroMarkQ48(CpG位点分辨率单个碱基)

9.激光共聚焦显微系统：ZeissLSM980(空间分辨率120nm)

10.微量紫外分光光度计：ImplenNanoPhotometerN60(检测限0.03ng/μL)

11.数字PCR系统：Bio-RadQX200(甲基化等位基因检测限0.001%)

12.冷冻研磨仪：SPEXSamplePrep6870(组织破碎粒径<5μm)

13.流式细胞分选仪：BDFACSAriaIII(分选纯度≥99%)

14.核磁共振波谱仪：BrukerAvanceIIIHD(组蛋白动态分析900MHz)

15.超速离心系统：BeckmanOptimaXPN-100(转速150,000rpm)

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

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注意：因业务调整，暂不接受个人委托测试，望谅解（高校、研究所等性质的个人除外）。

服务优势

1、拥有完善的检测服务体系，科学、严谨、认证。

2、我院对已出过的报告负责。

3、提供编写MSDS报告、TDS报告服务。

4、检测服务领域广，可参考标准多（国标、企标、通标、工标、国际标准等）。

5、周期短，费用低，方案全。

6、支持定制化试验方案，数据更加科学准确。

7、全国上门取样/现场见证试验。

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报告作用

1、工业问题诊断：包括失效分析、科学诊断、数据验证等，可以快速检测出产品问题，尽快止损；

2、其他鉴定服务：协助相关部门证据链补充、证物材料补充、质量检测、样品分析；

4、研发使用：试验经验丰富，试验设备多，为科研工作提供数据支持；

3、高校论文：提供研究性实验数据、分析服务，给论文提供科学依据；

5、投标：检测周期短，准确性高，出具的第三方检测报告合法合规；

7、控制材料质量，进行产品内控，降低成本、风险。

试验流程

1、与工程师沟通，确定具体的试验方案，我方报价；

2、双方签订委托书，我方接收样品；

3、进行细节沟通，我方进行试验测试；

4、试验测试完成，出具检测测试报告；

5、委托完成，我方提供售后服务。

检测仪器(部分)

合作客户(部分)

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